CF さんから教えてもらう。
/usr/ports/distfiles にパッチを落とす。
Makefile.local を作る。
vi /usr/ports/mail/qmail/Makefile.local
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PATCHFILES += qmail-date-localtime.patch
PATCH_DIST_STRIP = -p1
NO_CHECKSUM = yes
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こんな感じにしとくと、portupgrade のときも安心。
pkgtools.conf に書ければ後からメンテしやすいけど、
たしかに BEFOREBUILD に書く感じじゃないので、
現時点ではこの方法がベストエレガントっぽいね。